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ISSR/简单重复序列间扩增

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  • 发布时间:2016-03-28产品供应时间:长期有效

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ISSR/简单重复序列间扩增
 
        ISSR ( inter simple sequence repeat) 又称简单重复序列间扩增,是近年来发展起来的一类新型的分子标记技术。该技术根据植物基因组中丰富的简单重复序列设计单一引物,对基因组DNA进行扩增,利用了RAPD技术的优点和基因组中丰富的SSR序列信息,具有操作简单、可靠性强、重复性高、DNA模板用量少、不需预先设计引物的特点,可用来揭示样本间的遗传多样性。
       1)PCR-ISSR实验路线
       前期确认阶段:试验样本类型,数量,引物,签订试验合作合同;
       试验费用:DNA提取30元一个样本,PCR+电泳检测10元一个反应,分析单独收费(视工作量而定);23个样本,10对引物包括引物筛选试验费用大约4000元。
       试验阶段:DNA提取,PCR扩增,电泳检测
       数据分析:和客户详细沟通,确认分析方案:读取01矩阵;聚类分析;多样性分析;多态位点数(AP)、多态位点百分率( P)、平均等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei′s基因多样性指数(H)、Shannon′s信息指数(I) 、遗传分化度(Gst)等。利用NTSYS进行聚类分析。
       2)客户提供:
      ★ 基因组DNA:
          ●浓度为50-100ng/μL;(每个位点用2-3LμL,请根据引物数计算总体积)
          ●2%琼脂糖电泳检测有DNA主带,没有降解;
          ●DNA经过DNA纯化试剂盒或磁珠纯化;
          ●DNA需溶解在TE或灭菌的去离子水里;
          ●DNA溶解后,肉眼看不到杂色;
      ★ 植物材料: 新鲜组织,叶片采用硅胶干燥后或干冰运输;
      ★ 动物材料: 新鲜组织,无水乙醇封存低温运输;

                             

关键词:ISSR/简单重复序列间扩增,提供服务,技术服务,生物技术服务,分子生物学服务
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