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蛋白质组学分析包括分析蛋白质的结构和功能、翻译后修饰情况、蛋白质定位、蛋白质表达情况以及蛋白质间的相互作用等等。基于不同的分析内容可以采用不同的蛋白质组学分析技术和分析策略。
质谱技术是蛋白质组学分析最常用的技术之一。目前，基于质谱的蛋白质组学分析策略主要包括有自下而上蛋白质组学和自上而下蛋白质组学。在自下而上的蛋白质组学中，蛋白质在进入质谱分析之前需要先被消化成肽段，常见的非标记和标记的定量蛋白质组学技术等都采用的是这种策略。在自上而下的蛋白质组学中，蛋白质分子则不会被消化而是被直接分析，这样可以保留在自下而上策略中大部分被破坏的具有不稳定结构蛋白质的特征，同时也可以减少消化实验的时间消耗。针对不同的研究需求，研究人员可以选择适合的策略进行蛋白质组学分析。
蛋白质组学分析策略
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合nanoLC-MS/MS纳升色谱，提供不同策略的蛋白质组学分析服务：
基于Top down自上而下蛋白质组学
DIA-PRM蛋白质组学
PCT-DIA蛋白质组学
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