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热点实验:凝胶电泳迁移率(EMSA)实验案例介绍

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小鼠XX细胞药物干预及核因子蛋白A凝胶电泳迁移率(EMSA)检测
实验分组:
A组
 对照组(DMEM 1000ul)                      
B组 A药物组(DMEM 960ul+A药物40ul )            
C组 A药物+B药物组(DMEM 892.5ul+ A药物40ul+B药物 67.5ul)
D组 B药物组(DMEM 932.5ul+B药物 67.5ul)  
注:培养基与B药物,2小时候加A药物,24小时后收集细胞检测。

实验试剂:LightShift Chemiluminescent EMSA Kit(PIERCE,20148);Chemilumi-Nucleic Acid Detection Kit(PIERCE,89880);NF-KB p65探针序列;Boitin-N4-CTP(invitrogen,15918-18);TdT(NEB,M0252L);Poly(dI.dC) (sigma,P4929);Hybond-N+ 尼龙膜(Amersham,RPN303B);6×Loading Buffer (TAKARA)

实验仪器:离心机(湖南湘仪实验室仪器开发有限公司,TG16-W);电泳电源:Mini-PROTEAN 3 Elecreophoresis Cell,Mini Teans-Blot Module,and PowerPac Basic Power Supply (BIO-RAD,Catalog#165-3323);电泳仪及附件:Mini-PROTEAN 3 Elecreophoresis Cell (BIO-RAD,Catalog#165-3301);电转仪及附件:Mini Teans-Blot Elecreophoresis Transfer Cell (BIO-RAD,Catalog#170-3930);

生物素标记探针:
1、按如下顺序加入反应物,温和混匀,切勿涡漩
   超纯水                          25μl
   5×TdT Reaction Buffer         10μl
   探针(1μM)                     5μl
   Biotin-N4-CTP                  5μl
   TdT (2U/μl)                   5μl
   37℃反应30分钟
2、加入2.5μl 0.2M EDTA终止反应
3、加入50μl 酚:氯仿,短暂涡漩,15000g离心2min,保留上层水相,-20℃保存。
4、结合反应前等体积混合两条标记引物,90℃退火引物,并自然冷却至4℃,待用。

抽提核蛋白:
1、2-3×106密度铺60mm细胞培养板,培养约12h
2、移去细胞培养基,PBS洗细胞一次
3、加入1mL Buffer B 于培养板,将细胞刮下收集于1.5mL离心管
4、1000g 离心2min,吸去上清
5、加入160μl Buffer A,重悬沉淀,冰育20min
6、加入含2.5%NP-40的Buffer A,涡漩10s,4℃ 15000g 离心5min
7、吸去上清,加入40μl Buffer C,4℃涡漩25min,4℃ 18000g 离心5min
8、吸取2μl上清采用Bradford法测蛋白质浓度,其余储存于-80℃
   蛋白浓度测定如下表:mg/ml
             
No.
浓度
1
0.354
2
0.295
3
0.314
4
0.282
5
0.300
6
0.361
7
0.294
8
0.310
9
0.344
10
0.256
11
0.275
12
0.257
配置非变性聚丙烯酰胺凝胶:

EMSA实验步骤:
1、按如下顺序加入反应物,温和混匀(20μl体系)
   ddw                                 ――
   10×binding buffer                  2μl
   Poly(dI.dC)                         1μl
   核蛋白粗提物                        10μg(温和混匀)
   生物素标记的探针(0.1μM)           0.5μl
室温反应20min,加入6×Loading Buffer 4μl,上样10-20μl,100V电泳至溴酚蓝于三分之二处。
2、电转前将尼龙膜浸泡于0.5×TBE至少10min以预冷的0.5×TBE为电转缓冲液100V转胶于尼龙膜上,45min
3、UV BOX下,以贴近膜一面面向紫外光源,以254nm激发光交联15min
4、加入25mLBlocking Buffer,以约70rpm在脱色摇床上封闭30min
5、将SA-HRP以1:30000-50000稀释于12mL Blocking Buffer,脱色摇床70rpm作用20min(洗膜过程全部在脱色摇床上进行, 约100-140prm)
6、Buffer II  25ml,  5min
7、wash buffer 25ml  15min
8、Buffer III  25ml  5min×2次
9、0.1%SDS in 2×SSC, 5min×2次
10、0.1%SDS in 1×SSC, 10min×2次
11、0.1%SDS in 0.5×SSC, 5min×2次
12、将膜于滤纸稍适吸干,加入到以1:20稀释的发光反应液,作用1-5min,将尼龙膜封于保鲜膜中(避免褶皱和气泡的产生),暗室曝光1-5min,检测信号。
实验结果:采用Gel Pro 4.0 软件分析(核因子A band)IOD参考数值
p:probe only. 只加入标记探针未加入核蛋白抽提物。
C: Postive Control : 采用德国MERCK公司, Cat#71183-3,Cat#71377-3,Cat#71518-3试剂盒中Hela control Nuclear Extract
热点实验服务:凝胶电泳迁移率(EMSA)实验服务案例
 
热点实验服务:凝胶电泳迁移率(EMSA)实验服务案例
实验咨询:service@jiamay.com
 

 
嘉美生物是一家主要从事Annexin V,信号转导抗体,重组人和动物蛋白,磷酸化抗体,各种动物ELISA试剂盒,生物实验服务等研发与销售的高科技生物公司。

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