高通量测序
高通量测序-详情"高通量测序技术,又称为二代测序技术(Next Generation Sequencing, NGS)是在一代测序技术上发展而来的新一代测序技术。高通量测序技术克服了一代测序技术通量低、成本高的缺点,使同时分析几十万到几百万条序列成为现实,在大幅度提高通量的同时,保证了测序结果的准确性,降低了测序成本。高通量测序技术的问世使得我们能快速、细致、全面、深入的分析一个物种的基因组和转录组序列,揭开这些遗传物质的神秘面
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2023-09-11 09:30
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分泌蛋白的组学检测
分泌蛋白的组学检测-详情"蛋白质是生物体细胞功能的直接执行者,也是保证生命过程正常进行的重要物质。蛋白质在核糖体上合成,经内质网和高尔基体进行加工,成为成熟的、有生物学功能的活性蛋白。蛋白质都是在细胞内合成,但是细胞外也有各种蛋白质,执行不同的生物学功能。所以,蛋白质在细胞内合成后,会被转运到不同的部位发挥其特定的作用。分泌蛋白就是在细胞内合成后,分泌到胞外起作用的蛋白质,如各种消化酶、激素、淋巴因
多肽链氨基酸序列分析
多肽链氨基酸序列分析-详情"多肽是指由三个及以上氨基酸脱水缩合形成的小分子化合物,多肽与蛋白质之间没有明显界限,一般将氨基酸数量小于50或分子质量小于30kDa的称为多肽。蛋白质进行序列分析需要先将其酶解成多肽片段再进行后续操作,因此多肽氨基酸序列分析的方法和原理与蛋白质大同小异,蛋白质测序方法同样适用于多肽,如N端测序、C端测序、从头测序、肽质量图谱测序和基于质谱的序列分析等。百泰派克生物科技使用Thermo公
多肽质谱
多肽质谱-详情"多肽质谱就是利用质谱技术对多肽进行鉴定分析。多肽质谱分析的原理与蛋白质一样,都是通过串联质谱进行定性或定量鉴定。经色谱分离的多肽分子通过离子源进行离子化后,利用质谱仪进行一级和二级质谱检测,根据MS1和MS2数据,如多肽离子质荷比、质谱图等结合生物信息学分析,获取多肽的氨基酸序列信息或翻译后修饰信息,以实现多肽的鉴定和表征。百泰派克生物科技使用Thermo公司zuì新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱
蛋白组学数据如何分析
蛋白组学数据如何分析-详情"蛋白质组学分析中zuì重要也是zuì关键的一步就是对海量的数据进行相关的生物信息学分析,将数据可视化,获取我们研究需要的蛋白质的相关信息。那么蛋白组学数据分析又该从何做起呢?shǒu先,我们需要对获得的蛋白质组学数据进行快速的可视化分析,如主成分分析、相关性分析、火山图分析、韦恩图分析、热图分析以及聚类分析等,先对数据的整体情况进行大致了解,如样品均一性、样品间差异性以及变化趋
蛋白组学如何筛选差异蛋白
蛋白组学如何筛选差异蛋白-详情"差异蛋白筛选是根据蛋白质谱定量数据进行统计推断,从而寻找不同处理条件或不同状态下表达量存在显著差异的蛋白质。目前筛选差异蛋白的方法众多,根据不同的统计学派别可以分为经典的统计学策略、贝叶斯统计学策略和其他策略。经典的统计学策略,根据是否要求实验数据服从某种分布形式,分为基于分布假设的统计策略(如T检验、SAM等)和基于传统的非参数检验策略(如DESeq、Fisher精确检验、G检验等
蛋白组学联合磷酸化
蛋白组学联合磷酸化-详情"磷酸化是一种常见的真核生物蛋白质翻译后修饰,也是生物体zuì重要的修饰调控方式,参与诸多信号转导途径以及细胞代谢进程,如基因表达、转录调控、免疫调节以及细胞增殖、生长、分化、凋亡等,异常的蛋白质磷酸化还会引起一系列疾病。蛋白质组学联合磷酸化就是在组学水平上研究磷酸化修饰,即磷酸化蛋白质组学,主要任务就是解析蛋白质磷酸化位点、水平以及磷蛋白的结构等,以揭示某一具体生命活动与蛋白
非变性质谱
非变性质谱-详情"非变性质谱是相对于变性质谱而言,通常说的质谱技术一般是指变性质谱。变性质谱与非变性质谱在检测对象和zuì终目的两个方面有很大的区别,传统的变性质谱分析需要将蛋白样品进行酶解,再将小分子肽段进行质谱分析,蛋白质的天然结构、共价和非共价结合遭到破坏;而非变性质谱不需要进行样品前处理,可以直接检测完整的蛋白复合体。再者,利用变性质谱进行蛋白分析时主要是对蛋白质进行定性和定量鉴定;非变性质谱
蛋白质分离纯化及鉴定综合实验
蛋白质分离纯化及鉴定综合实验-详情"在蛋白组学研究中,如果要对某一混合体系中的蛋白质进行定性或定量分析,就需要先对蛋白组分进行分离、纯化,然后再进行后续的鉴定分析。这一系列实验环环相扣,每一步都至关重要,直接影响实验结果的准确性。理想的蛋白质分离技术shǒu先要有超高的分辨率,能够将成千上万不同类型的蛋白质包括它们修饰物进行有效的分离。目前常用的蛋白质分离技术包括一维/二维凝胶电泳技术、双向电泳技术以及
IP质谱
IP质谱-详情"IP(Immunoprecipitation)即免疫沉淀,是用于研究蛋白相互作用的一种分析技术。IP免疫沉淀基于抗体与抗原特异性结合的原理,利用已知的蛋白作为抗体,特异性识别并结合混合体系中的抗原蛋白,该技术广泛用于验证两种已知的蛋白相互作用或寻找未知的蛋白相互作用。IP质谱分析则是将免疫沉淀得到的蛋白利用质谱技术进行后续的定性定量检测,就可以明确两种相互作用的蛋白的种类及定量信息。目前IP质谱(IP-MS)已广泛用
4D-DIA蛋白质组学
4D-DIA蛋白质组学-详情"传统的蛋白质组学是基于肽段保留时间、离子强度和离子质荷比这三个维度对蛋白组进行检测分析,4D蛋白质组学在传统的三维分离基础上增加了离子淌度这一维度,提高了质谱仪器的检测性能和蛋白质组学的分析标准。4D蛋白质组学基于timsTOF Pro以及双TIMS和PASEF技术,大幅度的提高了数据采集速度、检测灵敏度和分辨率。DIA(Data independent acquisition)是一种数据非依赖采集模式。相较于3D蛋白组学采用的DDA
五种常见质谱仪
五种常见质谱仪-详情"质谱仪是一种产生离子并根据质荷比(m/z)分离离子的仪器。质谱仪的组件包括离子源、质量分析仪器、检测器和真空系统。目前已经开发出各种质谱仪来满足不同的需求。TSQ Quantum Access MAX三重四jí杆质谱仪Thermo Scientific TSQ Quantum Access MAX 三重四jí杆质谱仪TSQ Quantum Access MAX三重四jí杆质谱仪由Thermo Scientific公司推出,通常配备有液相色谱(LC)。该质谱仪配备有质量数高达
非靶向代谢组学和靶向代谢组学的特点和区别
非靶向代谢组学和靶向代谢组学的特点和区别-详情"代谢组学可以分为非靶向代谢组学和靶向代谢组学。非靶向代谢组学可以全面、系统地分析源自生物体的所有代谢产物,是一种可以发现新生物标志物的无偏代谢组学分析。靶向代谢组学是对特定代谢产物的研究和分析。两者都有各自的优点和缺点,并且经常结合使用以发现和准确测定差异代谢物的含量,对后续代谢分子标记物的深入研究和分析。非靶向代谢组学和靶向代谢组学参与食品鉴定、疾病
蛋白质组学在药物发现中的应用
蛋白质组学在药物发现中的应用-详情蛋白质组学是从整体的角度分析蛋白质组分的动态变化,包括表达水平和修饰状态,了解蛋白质之间的相互作用和联系,揭示蛋白质的功能和细胞生命规律,研究细胞内所有蛋白质及其行为的学科。蛋白质组学的概念被应用于药物研究领域,从而发展了药物蛋白质组学。该领域包括:发现所有可能的药物靶点和这些靶点的所有可能的化合物;药物作用机制和毒理学研究;药物筛选。还可以根据蛋白质谱对患者进行
蛋白质组学在微生物研究中的应用
蛋白质组学在微生物研究中的应用-详情细菌、放线菌和真菌等微生物在我们的星球上无处不在,它们广泛分布在土壤、水、人体等环境中。微生物及其活动对生物地球化学循环和所有生物系统都具有重要意义。在微生物的研究中有许多出色的成果:1. 地球化学循环研究;2. 帮助临床医生确定某种疾病或疾病发展的阶段;3. 确定可用于抗微生物药物开发的毒力因子;4. 使研究人员能够评估土壤、水和其他环境的污染状况;5. 帮助研究人员增加牲畜
自上而下、自中而下和自下而上分析法比较
自上而下、自中而下和自下而上分析法比较-详情自下而上蛋白质组学策略是一种将蛋白质/酶的大片段混合物分解成小片段肽以进行分析的传统蛋白质组学分析策略。广泛应用于蛋白质组学研究的质谱技术。自中而下蛋白质组学策略使用不同的酶来获得较长的肽。它可以分析和识别较长的肽链上同时发生的几种翻译后修饰。与自下而上的方法相比,它可以分析的肽的长度范围更大。自上而下的蛋白质组学策略不需要酶水解的过程,而是直接分析完整的
自上而下VS自下而上蛋白质组学
自上而下VS自下而上蛋白质组学-详情蛋白质研究是分析化学中zuì具挑战性的主题之一。zuì初的蛋白质研究专注于开发能够分离和鉴定蛋白质序列的技术。Edman降解法是一种蛋白质氨基酸序列分析的革命性方法。通过不同酶解结合蛋白质消化,高效液相色谱(HPLC)分离肽段后进行Edman降解可以确定蛋白质的完整序列。20世纪90年代,质谱法由于操作简、结果可靠,代替了Edman降解法用于蛋白质鉴定,质谱分析法还可对样品中的蛋白质进行收集
基因组学蛋白质组学代谢组学
基因组学蛋白质组学代谢组学-详情基因组学、蛋白质组和代谢组学分别独立但又相互关联,将它们进行整合分析可以更深入的解释生命现象和对各种生命现象的相关机制进行挖掘。百泰派克生物科技提供基于质谱的蛋白质组学、代谢组学和多组学整合分析服务。基因组学是一门致力于发现和记录特定生物整个基因组中所有序列的科学。基因组可以定义为细胞内完整的基因集。因此,基因组学是对生物遗传构成的研究。基因组学包括功能基因组学、比
基因组学蛋白质组学转录组学
基因组学蛋白质组学转录组学-详情基因组学、转录组学和蛋白质组学的研究对象分别为基因组(DNA)、转录组(RNA)和蛋白质组,它们相互关联和影响,一起调控生物体的各项生命活动。百泰派克生物科技提供多组学整合分析服务。基因组学是对生物体全基因组(WGS)的研究。虽然许多因素都会影响健康和疾病的状况,但是很明显个体的遗传背景(基因组)是一个很重要的决定因素。因此,检查这种遗传背景对于鉴定区分健康和疾病途径的个体突
脂质组学和代谢组学
脂质组学和代谢组学-详情脂质组是代谢组的一部分,脂质组学是代谢组学的一个分支。因为代谢组很复杂,所以需要采用多种分离和检测方法以更全面的分析代谢组。质谱可以用于多种代谢物的分析。百泰派克生物科技提供基于质谱的代谢组学和脂质组学分析服务。脂质组学和代谢组学代谢组学是对细胞、生物流体、组织或生物体内的小分子(通常称为代谢物)的大规模研究。这些小分子及其在生物系统内的相互作用统称为代谢组。由于代谢组很复
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