iTRAQ、TMT分析蛋白互作

iTRAQ、TMT分析蛋白互作-详情上一篇文章小编已经介绍过iTRAQ和TMT都是研究蛋白定量的技术，它们将经酶解后的蛋白质多肽在体外进行同位素标签标记，再结合质谱技术可同时对多种蛋白质进行定性和定量分析。iTRAQ和TMT技术除了用于蛋白定量分析外，还可不可以用于其他分析呢？有人问iTRAQ和TMT是否可以用于蛋白相互作用分析，根据两者的实验原理可知iTRAQ和TMT在蛋白互作分析上意义不大。目前分析蛋白相互作用的技术有很多，如免疫沉

内质网上蛋白质的糖基化

内质网上蛋白质的糖基化-详情糖基化是一种常见的蛋白质翻译后修饰，蛋白质在核糖体上合成后，会被运送到内质网上进行各种粗加工，如折叠、组装和共价结合短链碳水化合物的糖基化等，而成为较成熟的蛋白质。糖基化的蛋白质可以被视为带上了一定的“标记”，使其可以顺利进入高尔基体进行进一步的加工修饰，而不被降解。此外，糖基化修饰对蛋白质的结构和活性有重要影响，进而影响蛋白质的生物学功能，使其参与并调节各种生命活动进

免疫质谱

免疫质谱-详情免疫质谱技术联合基于抗体的免疫反应与质谱技术，将免疫反应沉淀下来的蛋白质或蛋白质复合物利用质谱仪进行后续的鉴定。免疫反应包括免疫沉淀反应（IP）和免疫共沉淀反应（Co-IP），两者原理相似，都是利用抗体抗原特异性结合的原理，将混合体系中能与抗体结合的蛋白质或蛋白-蛋白复合物沉淀下来。再利用质谱仪对免疫沉淀得到的蛋白质进行分析，可以对其进行定性鉴定，以验证已知的蛋白质相互作用或寻找未知的蛋白相

鸟枪法脂质组学

鸟枪法脂质组学-详情脂质组学就是研究生物体表达的全部脂质或某一体系中所有脂质的科学。脂质或称脂类，是一类不易溶于水而易溶于有机溶剂的小分子化合物的总称，包括脂肪和各种类脂，如磷脂、单甘脂和双甘脂等。脂质组学以脂质为研究对象，旨在研究有机体或系统中的全部脂质，以及它们与其他脂质或生物分子（如蛋白质，代谢物）的相互作用，进而揭示脂质参与的一系列代谢过程或调控通路的分子机理。鸟枪法脂质组学，又称为Shotgun

蛋白质组学筛选差异蛋白

蛋白质组学筛选差异蛋白-详情蛋白质组学筛选差异蛋白就是差异蛋白组学研究的主要内容，差异蛋白组学就是在组学水平上研究不同状态或不同处理条件下表达水平存在显著差异的蛋白质，以研究生物体在不同条件下的反应机制，是研究和认识生命活动本质的一个有效途径。差异蛋白质组学在一定程度上揭示了生命活动变化的分子机理，在疾病的诊断、发生、病程和疗效监测上有着重要意义，也广泛应用于作物育种工程和基因工程产物鉴定等。液相

抗体N糖基化位点

抗体N糖基化位点-详情糖基化修饰指蛋白特定氨基酸残基共价结合糖链的过程，是常见的蛋白翻译后修饰方式，占所有翻译后修饰的一半以上。根据糖链的类型和发生糖基化的氨基酸位点，可以将糖基化修饰分为N-连接糖基化和O-连接糖基化等。抗体N糖基化就是抗体蛋白的氨基酸残基共价结合N糖的过程，N型糖苷键对肽链中的氨基酸的排列顺序有特殊的要求，只与Asn-X-Ser/Thr序列中的天冬酰胺的氨基形成糖苷键（其中X代表除Pro以外的任一氨基酸

抗体序列分析

抗体序列分析-详情抗体是由4条多肽链组成的能特异性结合抗原的免疫球蛋白，在机体的免疫系统中发挥着非常重要的作用，如清除侵入体内的各种病原微生物、病毒和寄生虫等异物，维持机体的平衡。一些抗体可以在体外合成各种抗体药物，如单克隆抗体等，作为疾病的治疗手段。因此，抗体氨基酸序列的信息无疑是抗体合成必需的前提条件。抗体本质是一种免疫球蛋白质，抗体序列分析就是对组成抗体多肽的氨基酸序列进行鉴定。分析方法和原理

检测蛋白氧端糖基化

检测蛋白氧端糖基化-详情蛋白糖基化修饰指碳水化合物残基（寡糖或聚糖）通过糖苷键共价结合在蛋白肽链的特定氨基酸残基的过程，是生物体中常见的蛋白翻译后修饰方式。根据连接在氨基酸上的碳水化合物种类可以将糖基化分为N-连接糖基化、O-连接糖基化以及糖基磷脂酰肌醇锚糖三类。蛋白糖基化检测的主要内容就是分析蛋白是否发生糖基化、发生何种糖基化、发生糖基化的氨基酸位点以及糖基化的水平。蛋白氧端糖基化即O-连接糖基化，是

甲基化分析方法

甲基化分析方法-详情蛋白甲基化是真核和原核生物中常见的翻译后修饰方式，常发生在组蛋白和非组蛋白如转录调控因子、细胞信号通路分子以及肿瘤抑制蛋白等蛋白分子上。甲基化分析的主要任务就是鉴定蛋白是否发生甲基化、发生甲基化的氨基酸位点以及甲基化的水平。目前，蛋白甲基化分析方法主要有高效液相串联质谱法和抗体法。质谱法凭借其高通量、高精度和高准确性等优势已成为当前蛋白甲基化分析的重要工具，大致分析流程是先将待

蛋白质谱数据比较

蛋白质谱数据比较-详情蛋白质谱数据比较就是将蛋白质谱分析的得到的数据图进行比较分析，可以理解成两种意思：一种是将单个肽段离子的质谱图数据与检索数据库中的理论值进行比较，即对质谱获得的肽离子质量与理论肽质量进行比较和评价，从而实现蛋白肽段的鉴定；另一种可以理解为将不同蛋白组间的肽段离子质谱数据进行比较，以从整体水平分析组间的异同等。百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合n

iTRAQ、TMT、Label-Free

iTRAQ、TMT、Label-Free-详情研究蛋白质含量的技术主要分为标记和非标记两种策略，其中iTRAQ和TMT为体外标记蛋白定量，Label-Free为非标记定量技术。iTRAQ/TMT/Label-Free是三种不同的蛋白定量技术：iTRAQ（isobaric tags for relative and absolute quantitation）即同位素标记相对和绝对定量技术。iTRAQ技术通过同位素标记来实现蛋白质定量研究，经水解的蛋白质多肽N末端或赖氨酸侧链基团可以被同位素标记，通过高精度

蛋白质谱生信分析

蛋白质谱生信分析-详情蛋白质谱生信分析就是对质谱数据进行生物信息学分析。所谓质谱数据就是质谱仪通过检测肽段母离子的质荷比（m/z）而得到的图谱，如肽质量指纹图谱（PMF）、肽序列图谱（PST），一般利用各种软件、数据库将质谱获得的肽离子质量与理论肽质量进行比较和评价，从而实现该肽段乃至整个蛋白的鉴定和序列分析。常用的检索工具主要包括PeptIdenet、MS-Fit、ProFound、PeptideSearch、MS-Taq、MS-Seq、PepFrag、Mascot

蛋白质谱结果怎么分析

蛋白质谱结果怎么分析-详情利用质谱仪对蛋白质进行分析鉴定可以得到不同的数据，如一级质谱数据和二级质谱数据，这些质谱数据也就是质谱结果，都需要结合数据库、软件等进行生物信息学分析才能实现蛋白质的鉴定及序列分析等。蛋白质一级质谱数据主要是分析蛋白质酶切产生的肽段质量图谱，即肽质量指纹图谱（Peptide Mass Fingerprint，PMF），再将PMF中的肽质量数据与数据库中理论肽质量进行比较和评价，从而实现肽段的鉴定。常用

甲基化蛋白质检测

甲基化蛋白质检测-详情甲基化是将活性甲基化合物（如硫代腺苷甲硫氨酸，SAM）的甲基在酶催化作用下共价转移到其他化合物（核酸或蛋白质）的过程。蛋白质的氨基酸残基共价结合甲基基团就称为蛋白质甲基化，发生了甲基化的蛋白质就称为甲基化蛋白质。蛋白质甲基化通常发生在精氨酸或赖氨酸残基上，精氨酸残基可以共价结合1个或2个甲基，即一甲基化精氨酸和二甲基化精氨酸；赖氨酸残基可以共价结合1-3个甲基基团。根据共价结合在氨基

化学交联质谱

化学交联质谱-详情化学交联质谱（Chemical cross-linking coupled with mass spectrometry，CXMS）是利用化学交联剂的交联作用，研究蛋白质或蛋白-蛋白复合体的空间结构以及相互作用的技术。化学交联质谱技术利用带活性基团的化学交联剂，将空间距离在化学交联剂臂长范围内的两个氨基酸通过稳定的共价键（酰胺键）连接起来，再将发生交联后的蛋白质酶切后进行质谱分析，对被交联的氨基酸残基鉴定，实现蛋白质（复合物）三维构象以

互作蛋白组

互作蛋白组-详情蛋白质作为生物体细胞功能的执行者，并不全是“单枪匹马的作战”，一些蛋白需要与其他蛋白质相互结合形成复杂的蛋白复合体才能发挥特定的生物学功能，如血红蛋白、组蛋白等。由于蛋白质相互作用在生命过程中扮演的重要作用，互作蛋白组学应运而生。互作蛋白组学以相互作用的蛋白质组为研究对象，利用组学技术对相互作用的蛋白质进行定性和定量分析、寻找未知的相互作用蛋白，旨在揭示特定生物学过程的分子机制，把

SILAC

SILAC-详情SILAC（Stable Isotope Labeling By Amino Acids In Cell Culture）是Thermo Fisher公司研发的一种体内标记蛋白质定量技术，即细胞培养中氨基酸的稳定同位素标记。该技术的基本原理是利用轻型、中型或重型同位素标记的必需氨基酸（如Lys、Arg等）进行细胞培养，使新合成的蛋白质带上同位素标记，提取经不同处理条件后的细胞蛋白并等量混合，通过凝胶或色谱分离、酶解消化后进行串联质谱分析，根据一级质谱和二级质谱数据

谷氨酸蛋白酶 蛋白质质谱分析

谷氨酸蛋白酶 蛋白质质谱分析-详情"蛋白质质谱分析技术可用于蛋白质定性和定量鉴定、蛋白质序列分析以及蛋白质结构预测等。质谱仪只能对离子化形式的物质进行检测，在进行蛋白质质谱分析前，需要将蛋白质酶解为小分子肽段，再利用离子源电离为肽段离子，zuì后利用质谱仪进行检测，所以蛋白酶解是样品制备的关键步骤。蛋白质质谱分析中常用的蛋白水解酶主要有胰蛋白酶（Trypsin）、谷氨酸蛋白酶（Glu-C）、糜蛋白酶（Chymotrypsin

非定量蛋白质组学

非定量蛋白质组学-详情"定量蛋白组学技术根据是否使用标签标记分为标记和非标记两种策略，即标记定量蛋白质组学和非标记定量蛋白质组学。目前还没有非定量蛋白质组学这一说法，可能刚入门的蛋白质组学研究者对这些专业术语不够了解，误把非标记定量蛋白质组学当成非定量蛋白质组学。非标记定量蛋白质组学技术又称为Label Free蛋白质定量技术，其一般的分析流程为将未标记的蛋白样品进行酶解、消化为小分子肽段，再利用串联质谱技术

iTRAQ

iTRAQ-详情"iTRAQ（isobaric tags for relative and absolute quantitation）即同位素标记相对和绝对定量技术，是由AB SCIEX公司研发的一种基于标签的蛋白质定量技术。iTRAQ技术通过同位素标记来实现蛋白质定量研究，其基本原理为：将水解得到的蛋白质多肽N末端或赖氨酸侧链基团用同位素试剂标签标记，再将该混合物进行高精度串联质谱分析，根据信号峰强度等质谱信息实现对样品蛋白的定量和定性分析。iTRAQ含有8种不同的试剂标签，