翻译后修饰蛋白质组与代谢组整合分析
翻译后修饰蛋白质组与代谢组整合分析-详情蛋白质的翻译后修饰(Post Translational Modifications, PTMs)是蛋白质在翻译中或翻译后经历的一个共价加工过程。翻译后修饰蛋白质组是指细胞或组织等整体水平上的翻译后修饰蛋白质。目前,已知的蛋白质翻译后修饰主要包括糖基化、磷酸化、酰化、泛素化、二硫键配对、甲基化和亚硝基化等等。代谢组是细胞、组织或生物体内的小分子(通常称为代谢物)的整体水平。翻译后修饰蛋白质可以调
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2023-09-18 13:09
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蛋白磷酸化鉴定技术介绍
蛋白磷酸化鉴定技术介绍-详情蛋白质表达以后,在发挥真正功能之前,会经过多种不同的翻译后修饰,例如,磷酸化,乙酰化,糖基化等基团修饰。本文主要讲下两种研究蛋白磷酸化修饰的方法:Western Blot和质谱检测法。蛋白质翻译后修饰种类蛋白磷酸化修饰过程蛋白磷酸化修饰这一过程是通过蛋白激酶催化,将磷酸基团从ATP转移到多肽底物的丝氨酸、苏氨酸,或酪氨酸残基上。并且磷酸化修饰的过程是可逆的,去磷酸化反应由蛋白磷酸酶催化
蛋白质等电点的测定
蛋白质等电点的测定-详情蛋白质表面存在一些酸碱性离子基团,如氨基、羧基、酚基、巯基等,因此蛋白质与氨基酸一样本身带有净电荷。在不同pH的溶液中解离所带的正负电荷不同,在某一pH值的溶液中,其解离的正负电荷相等,这时溶液的pH值就称为蛋白的等电点(isoelectric point, pI)。蛋白质的等电点与其空间结构有关,因此对于某一特定蛋白质来说其等电点也是固定的。当蛋白质处于与其等电点相同pH的溶液中时,在该溶液中的溶解度
定量蛋白组分析
定量蛋白组分析-详情细胞内蛋白质组丰度的动态变化对各种生命过程有重要影响。例如在许多疾病的发生和发展进程中,常常伴随着某些蛋白质的表达异常。定量蛋白质组学就是把一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂的混合体系中所有的蛋白质进行精确的定量和鉴定。目前定量蛋白质组学技术主要分为标记(Label)和非标记的(Label Free)定量策略,其中标记策略又分为体内标记(如 SILAC、15^N 标记),以及体外标记(如 iTRAQ、TMT 标
蛋白质磷酸化修饰类别、富集和鉴定方法
蛋白质磷酸化修饰类别、富集和鉴定方法-详情导读• 蛋白质磷酸化修饰定义?• 蛋白质磷酸化修饰类别?• 蛋白质磷酸化鉴定方法有哪些?• 蛋白质磷酸化肽段富集方法?在哺乳动物细胞生命周期中,大约有1/3的蛋白质发生过磷酸化修饰,在脊椎动物基因中,约有5%的基因编码的蛋白质是参与磷酸化和去磷酸化过程的蛋白激酶和磷酸酶。它可以通过激发、调节诸多信号通路进而参与调控生物体的生长、发育、逆境应激、疾病发生等多种生命过程
怎么测蛋白磷酸化
怎么测蛋白磷酸化-详情蛋白磷酸化检测shǒu先要明确该蛋白样品是否发生磷酸化修饰,如有磷酸化修饰,那么再分析发生磷酸化的氨基酸位点以及发生磷酸化的肽段含量。目前蛋白质磷酸化分析的方法主要有放射性标记法(32P)、免疫印迹法、荧光染色法和质谱法等。放射性标记法先用32P标记ATP,通过细胞代谢标记到磷酸化蛋白质上,再经一维或二维凝胶电泳或色谱法进行分离,zuì后通过放射自显影进行检测。免疫印迹法基于抗体特异性结合
单细胞质谱流式技术分析
单细胞质谱流式技术分析-详情随着现代生物学的发展,“平均值”这个词已经不能满足我们的研究需要了,我们需要更进一步了解细胞之间的差异性,于是针对单细胞的各类研究技术应运而生。单细胞质谱流式(Mass Cytometry)技术是利用质谱技术对单细胞进行多参数检测的流式技术,它既有传统流式细胞术能够高速分析的特点,又兼并了质谱检测的高分辨能力。单细胞测序和质谱流式都是目前非常强大的技术,越来越多的高分文献都是将两者结
2023-09-11 09:30
基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现
基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现-详情所有经由HLA-I、II分子呈递在细胞表面,供T细胞检测识别的短肽,称为免疫多肽组(Immunopeptidome)。免疫多肽组学分析,旨在研究I型和II型免疫肽的动力学和组成。免疫多肽组学的深入表征可以应用于癌症、免疫疾病和传染病的新疗法的开发。免疫肽是由有核细胞在HLA或MHC抗原呈递途径的I型和II型蛋白上提交的全部肽。它在细胞介导和体液反应中定义免疫原性表位是必不可少的。确定
基于LC-MS-MS的蛋白质组学
基于LC-MS-MS的蛋白质组学-详情蛋白质组学是对生物系统中所有蛋白质的全面分析,基于质谱的蛋白质组学已成为鉴定和量化生物体蛋白质组的shǒu选工具,随着质谱和分离方法的zuì新进展,液相色谱-串联质谱(LC-MS-MS)技术得以诞生并在包括蛋白质组学在内的各种组学研究广泛运用。LC-MS-MS 技术将质谱的高精度鉴定与色谱的分离技术结合起来,可高通量提供待测物的定性和定量分析。基于LC-MS-MS的蛋白质组学是一种自下而上的蛋白质组
基于SILAC的定量MS
基于SILAC的定量MS-详情SILAC(Stable Isotope Labeling By Amino Acids In Cell Culture)细胞培养中氨基酸的稳定同位素标记是一种自下而上的非靶向标记蛋白质质谱定量技术,基于SILAC的定量MS即利用依赖质谱的SILAC技术进行蛋白质定量鉴定,其鉴定的原理是将正常必需氨基酸(轻标记)和同位素修饰氨基酸(重标记)掺入细胞培养物中,使新合成的蛋白质带上轻、重同位素标记,然后提取并消化细胞中的蛋白质进行LC-MS/MS分析,根据
单细胞测序
单细胞测序-详情单细胞测序技术是指对单细胞基因组或转录组进行测序,以获得基因组、转录组或其他多组学信息,从而揭示细胞群体差异和细胞发育谱系关系。传统的测序方法一般获得的信息来自于混合细胞样品,这样测序的方式往往丢失了细胞的异质性信息。单细胞测序技术结合优化的NGS测序技术,在检测单个细胞之间的异质性、识别稀有细胞、绘制细胞图谱等方面具有jí大优势。可以帮助研究人员研究细胞功能,更好地理解细胞间分化、细
植物蛋白质组学
植物蛋白质组学-详情植物蛋白质组学(Plant Proteomics)是蛋白质组学领域的一个分支,旨在研究植物蛋白质的组成、结构、功能、相互作用及调控机制等,其研究方法与蛋白质组学类似,涉及的核心技术包括蛋白质的分离、纯化、鉴定、功能注释、相互作用研究和表达调控研究等。植物蛋白质组学的研究,不仅能为植物生长发育和逆境适应的规律提供物质基础,也能为农作物抗逆性和品质改良提供理论根据和解决途径。通过对不同生长条件下、
基质辅助激光解析电离质谱蛋白用什么溶解
基质辅助激光解析电离质谱蛋白用什么溶解-详情基质辅助激光解析电离质谱(MALDI-TOF)将蛋白样品包埋在固相基质中,利用基质将激光的能量均匀的传递给样品,避免了样品直接接受强烈的激光能量,保护蛋白质分子不受破坏而电离成碎片离子。样品的缓冲液、基质的类型以及基质和样品的混合程度都会影响电离的结果,进而影响到样品分析的分辨率、灵敏度和准确度。因此,在利用MALDI-TOF分析蛋白时缓冲液和基质的选择相当重要,蛋白缓冲
iTRAQ与TMT
iTRAQ与TMT-详情蛋白质是生命物质的重要组成成分,在组成细胞的有机化合物中占7%-10%,其种类和含量的变化与其生命活动息息相关。定量蛋白质组学通过对一个体系的全部蛋白质进行精确的定性和定量鉴定来揭示生命体某项生命活动过程中蛋白质的变化。定量蛋白质组学技术主要分为标记和非标记两类,标记定量蛋白组学技术又分为体内标记和体外标记。iTRAQiTRAQ (isobaric tags for relative and absolute quantitation)是由AB SCIEX公司
交联蛋白组学分析
交联蛋白组学分析-详情交联蛋白质组学分析利用交联法进行蛋白质组学研究,主要用于解决蛋白质相互作用研究中的问题,交联法依托交联剂在两个或多个蛋白质特定氨基酸残基之间形成化学键而将相互作用的蛋白质紧密结合在一起,可以维持蛋白质间的相互作用,捕获微弱、短暂的相互作用的蛋白质根据反应进行的场所和交联剂的类型可将交联法分为体内和体外交联、同源和异源以及光敏交联。体内交联反应在细胞内进行,有利于保持蛋白活性,
泛素化修饰组学
泛素化修饰组学-详情泛素化修饰组学定义泛素化修饰(Ubiquitylation)是一种广泛存在于真核生物中的蛋白翻译后修饰。泛素(Ubiquitin, Ub)本身是一种小分子多肽,在相关酶的作用下,Ub能通过共价键连接在底物蛋白或目标蛋白上,这一过程就称为泛素化修饰。根据蛋白所连接的泛素分子的多少,可以将泛素化分为单泛素化和多泛素化;根据Ub所在的位置又将多泛素化分为多聚泛素化和线形多聚泛素化。泛素化修饰主要介导蛋白质发生降解,但随
绝对定量(aqua)蛋白质组学
绝对定量(aqua)蛋白质组学-详情定量蛋白质组学是一种强大的方法,用于发现和靶向蛋白质组学分析,以了解细胞、组织或生物体中的全部蛋白质组学动态。大多数定量蛋白质组分析需要实验组中蛋白质或肽的同位素标记,然后可以通过质谱法进行区分。基于质谱的蛋白质定量方法可以分为相对定量和jué对定量两种。相对定量方法(SILAC、ICAT、ICPL和等压标签)用于比较样品之间的蛋白质或肽丰度,而具有已知同位素标记合成肽浓度的未标记样
泛素化蛋白质鉴定
泛素化蛋白质鉴定-详情蛋白泛素化定义蛋白泛素化是一种重要的蛋白质翻译后修饰形式,常发生在真核生物体内。在ATP供能的条件下,一系列泛素化酶将小分子多肽-泛素通过三个级联反应与目标蛋白质或底物蛋白质的赖氨酸残基发生共价结合,根据蛋白质连接的泛素分子的多少以及方式,可以将泛素化分为单泛素化、多聚泛素化和线形多聚泛素化。泛素化修饰在生命活动方面具有重要的调控作用,主要介导蛋白质发生降解,此外,还参与细胞的生
抗体蛋白翻译后修饰
抗体蛋白翻译后修饰-详情蛋白质翻译后修饰(PTMs)通过共价添加官能团或蛋白质,调节亚基的蛋白水解切割或整个蛋白质的降解来增加蛋白质组的功能多样性。目前已发现400多种PTMs,包括磷酸化,糖基化,泛素化,亚硝基化,甲基化,乙酰化,脂化和蛋白水解等,这些修饰作为调节各种细胞过程的关键分子调节机制发生,对蛋白质的结构和功能有重大影响并影响正常细胞生物学和发病机制的几乎所有方面。百泰派克生物科技采用Thermo Fisher
蛋白质磷酸化位点检测
蛋白质磷酸化位点检测-详情蛋白质磷酸化定义蛋白质磷酸化是一类由蛋白激酶催化的重要的蛋白质翻译后修饰,在蛋白激酶的作用下,三磷酸腺苷(ATP)或三磷酸鸟苷(GTP)的末端磷酸分子断裂,与底物蛋白的丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)或酪氨酸(Tyr)残基共价结合导致蛋白质磷酸化。蛋白激酶具有特异性,不同的蛋白激酶催化不同的底物蛋白氨基酸发生磷酸化,Ser/ Thr型蛋白激酶催化底物蛋白的Ser或Thr残基发生磷酸化;Tyr型蛋白激酶
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