GC色谱分析
GC色谱分析-详情色谱法(Chromatography)是上世纪五十年代出现的一种化合物分离、分析技术,在化学、生物医学、药学以及食品领域的分离和分析中广泛应用。色谱法的分离以化合物在流动相与固定相之间的相互作用为基础,当溶于流动相中的化合物经过固定相时,由于与固定相发生作用的大小以及强弱不同,导致化合物在固定相中滞留的时间不同而先后从固定相中流出,从而实现各化合物组分的分离。根据流动相的物理状态,可以将色谱法分
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2023-09-11 09:28
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GCMS代谢组学
GCMS代谢组学-详情代谢组学(Metabolomics)是研究细胞、组织、器官或生物体内所有内源性小分子代谢物的科学,如氨基酸、糖类、脂肪酸、甾醇、儿茶酚胺和生物胺等,通过对其种类、含量以及变化规律的研究,旨在表征和定量生物系统中的代谢组,揭示机体在不同状态下的代谢通路。作为基因组、转录组以及蛋白质组的“终端”产物,代谢组可以更直接的反映生物体的生理和病理状态,为临床诊断、疾病治疗以及寻找生物标志物提供了新的方
GC-MS非靶标代谢组分析
GC-MS非靶标代谢组分析-详情代谢组学是一种全面的代谢分析方法,能以无偏见的方式同时分析广泛的代谢物类别。代谢组学方法可分为靶向和非靶向两种。靶向代谢组学是指对一组选定的代谢物(例如氨基酸、脂质、糖和/或脂肪酸)进行定量测量,以研究特定的代谢途径或验证使用非靶向代谢分析确定的生物标志物。相比之下,非靶向代谢组学方法涉及代谢组的全局分析,旨在快速可靠地识别特定生理状态的小分子生物标志物,与靶向代谢组学相
FFPE定量蛋白质组学
FFPE定量蛋白质组学-详情FFPE(formalin fixation and paraffin embedding)即福尔马林固定的石蜡包埋样本,能在室温下zuì大限度的封存某一状态下的样本,广泛应用于组织学和形态学结构的保存。一些临床上的石蜡包埋样本对疾病组织病理学诊断具有jí高应用价值,是研究癌症等重大疾病的宝贵资源。FFPE定量蛋白质组学通过质谱技术对FFPE 组织蛋白提取液中的蛋白组分进行精确定量分析,对比正常与病理状态下蛋白质的表达情况,发现
CD24糖基化位点
CD24糖基化位点-详情糖基化是真核生物中常见的较复杂的蛋白翻译后修饰方式,在维持和调控机体各项生命活动中扮演着重要角色,一些异常的蛋白糖基化可能还与疾病的发生有密切关系。CD24是一种由31个氨基酸组成的小分子短肽,又称为热稳定抗原或小细胞肺癌簇4抗原,与鼠热稳定抗原高度同源。CD24是一种高度糖基化的细胞粘附分子,通过磷脂酰肌醇锚定在细胞膜内的脂质筏上,介导细胞与细胞和基质间的黏附,在细胞识别、信号转导、增值
Bottom-up测序
Bottom-up测序-详情通过质谱进行蛋白质组学分析主要有“自上而下”(Top-down)和“自下而上”(Bottom-up)两种策略。“自上而下”策略对完整的蛋白质或多肽进行全局分析,“自下而上”策略通过对蛋白质或多肽水解后的小分子肽段进行分析从而实现完整蛋白或多肽的鉴定分析等。Bottom-up测序基于自下而上的策略对蛋白质进行序列分析,是一种较为传统的蛋白质测序手段。与基因测序的原理相似,通过拼接多种蛋白酶切割蛋白质产生的肽
ADC药物蛋白质组学
ADC药物蛋白质组学-详情药物蛋白质组学就是将蛋白质组学理论研究技术与药物研究领域相结合的新兴科学。其研究的基本内容为通过对比正常和病理状态下的细胞或组织的蛋白质表达情况,对药物作用机制和药物不良反应等进行分析,旨在寻找新的药物靶点、构建分子药理筛选模型等。ADC(抗体偶联药物)是一类结合免疫疗法和化学疗法的新型生物药物,其开发涉及单克隆抗体及抗体靶点的选择、连接物和化学物的选择。ADC药物蛋白质组学研究可
ADCs药物的DAR
ADCs药物的DAR-详情抗体偶联药物(Antibody-Drug Conjugates,ADCs)是将具有高度靶向性的单克隆抗体与具有强效杀伤力的细胞毒素通过特定的偶联剂连接在一起的新型药物,对靶标细胞同时具有高度选择性和杀伤力,在癌症以及肿瘤等疾病的治疗中具有重要作用。抗体偶联药物的制备一般是先将重组抗体与特殊的连接子结合形成抗体-偶联剂复合物,再将其与化学药物——细胞毒素相连。然而在这个过程中可能会由于连接不成功产生未偶联的裸
ADCs
ADCs-详情ADCs(Antibody-Drug Conjugates)即抗体偶联药物,是一类由重组抗体和细胞毒素通过偶联剂连接在一起形成的新型生物药物,在肿瘤和癌症的治疗中具有很重要的应用价值。ADCs由三部分组成:重组的单克隆抗体、具有药效的细胞毒素以及特殊的连接物。重组的单克隆抗体具有很强的靶向性,能特异性的识别肿瘤细胞,但是其对靶标肿瘤细胞的伤害度不高;细胞毒素对肿瘤细胞具有很强的杀伤力,但是其特异性较差,会同时伤害到机体
Edman降解法相对于质谱法有何优势
Edman降解法相对于质谱法有何优势-详情Edman降解法和基于质谱的方法是目前zuì常用的蛋白质序列分析方法,Edman降解法主要用于蛋白质N末端序列的测定,质谱法可对蛋白质全长序列进行分析,也可用于N/C端序列分析,这两种方法都有各自的优点和局限,Edman降解法相较于质谱测序法具有以下几点优势:(1)Edman测序法每次对一个被降解下来的氨基酸进行鉴定,鉴定结果准确度高;(2)Edman降解法不依赖任何蛋白质序列数据库,可对数据
SDS-PAGE蛋白纯度鉴定
SDS-PAGE蛋白纯度鉴定-详情一般实验分离的蛋白质常常会含有一些杂质蛋白或提取步骤中使用的试剂等,影响后续实验的顺利进行,因此有必要对其进行纯化,并对纯化结果进行检测,即蛋白质纯度测定。蛋白质纯度测定可以评价蛋白质是否含有杂质以及杂质的含量,是进一步研究蛋白质至关重要的环节。一些蛋白产品尤其要进行纯度检测,以确保产品的质量和安全性。随着生命科学研究的发展进步,蛋白纯度鉴定的方法也越来越多样化,包括电泳
Edman法一次可以测出多少序列
Edman法一次可以测出多少序列-详情Edman降解法是针对蛋白质N末端氨基酸序列分析的方法,用于测定蛋白质N末端的氨基酸序列。基于Edman降解法的测序仪一般只能连续降解并测定几十个(60~70)N末端氨基酸,zuì多不会超过一百个。对于更长的N末端序列或者蛋白质的全长序列,可以利用蛋白酶将其水解为多个小片段的短肽,然后利用Edman降解法进行分析,通过序列拼接实现更长序列的N末端序列分析甚至蛋白质全长序列鉴定。百泰派克公司采
Edman降解测序的试剂及其基本原理是什么
Edman降解测序的试剂及其基本原理是什么-详情Edman降解法是蛋白质N末端序列分析的经典方法,其利用一系列化学反应每次从肽链上切下一个氨基酸并进行鉴定,如此循环以完成N末端氨基酸的序列测定。Edman降解法主要用到的试剂为异硫氰酸苯酯(PITC),PITC能与蛋白质多肽的N末端氨基酸残基发生偶联反应生成苯氨基硫甲酰衍生物(PTC-肽),在三氟乙酸处理下,N末端氨基酸的肽键被选择性的切断,释放出含有该末端氨基酸的噻唑啉酮苯胺(
DNFB和Edman原理相同吗
DNFB和Edman原理相同吗-详情DNFB和Edman是两种不同的蛋白质N末端序列分析方法,其原理不相同但是非常类似,都是利用化合物与蛋白质的末端氨基酸进行反应生成氨基酸-化合物复合体,再对该产物进行鉴定从而实现N末端氨基酸序列的分析,只是两者利用的化合物以及反应的原理不同。下面对两种方法的原理进行简单介绍。DNFB即2, 4-二硝基氟苯,在弱碱性环境(pH=8.0~9.0)下可以与蛋白质N末端的α氨基酸结合生成稳定的2, 4-二硝基苯氨基
DIA需要分组分进样吗
DIA需要分组分进样吗-详情基于DIA的质谱技术分析蛋白质操作简便,不需要混样和分组进样,即可对大样本进行高通量高精确度的定量分析。DIA数据非依赖性采集方式可以进行质谱全扫描,将整个质谱扫描的质量范围分为若干个不同的小窗口,然后对每个窗口的所有离子进行高速、循环的碎裂、隔离、扫描和检测,以采集所有离子的碎片信息,无数据丢失,样本重现性好,且质谱操作简便,不需要分组分进样,样本处理很少,为个体化蛋白质组学分
DIA方法蛋白质组学分析差异蛋白
DIA方法蛋白质组学分析差异蛋白-详情蛋白质组学差异蛋白分析就是对不同处理条件或不同时期/状态下表达水平存在显著差异的蛋白质进行比较,寻找有意义的差异蛋白,为揭示机体响应外界变化的生理分子机制提供了理论依据。差异蛋白质分析建立在蛋白质含量水平上,已知的各蛋白质组分的含量是进行差异蛋白分析的前提。DIA是一种质谱数据采集方式,可以zuì大限度的采集所有离子的碎片信息,对蛋白质进行高通量、高精确度的定量鉴定。基
DIA定量蛋白组学
DIA定量蛋白组学-详情目前定量蛋白质组学研究可以分为传统的基于DDA的蛋白质定量策略、基于MRM/SRM/PRM的靶向蛋白质定量策略以及基于DIA的蛋白质定量策略。基于DDA的蛋白质定量策略如Label Free、iTRAQ、TMT和SILAC等利用液相色谱串联质谱技术(LC-MS/MS)可以对成百上千种蛋白质进行检测和相对/jué对定量,这些方法基于DDA数据依赖采集模式来采集质谱数据,数据缺失较多、重复性低、定量数据不精准,难以检测到低丰度的蛋白。基
DIA蛋白质组学研究流程及样品前处理
DIA蛋白质组学研究流程及样品前处理-详情DIA蛋白质组学基于全息式采集模式的质谱技术对蛋白质组进行相关研究,理论上可采集所有肽段离子的一级和二级质谱信息,对蛋白质进行高精确度的检测分析,常用于蛋白质的相对和jué对定量分析。DIA蛋白质组学研究流程大致为将提纯后的蛋白粗提取物酶切消化成小分子肽段,依次进行高效液相色谱分离和SWATH模式下的质谱检测,zuì后将质谱数据结合相关软件和生物信息学分析转换为我们需要的生
DIA蛋白质组学和iTRAQ分析
DIA蛋白质组学和iTRAQ分析-详情DIA是一种质谱分析中使用的数据采集方式,即数据非依赖性采集模式,在这种采集模式下,不用预先设定条件对肽段母离子进行筛选,而是将整个质谱扫描范围分为多个不同的小窗口,依次并循环的对每个窗口的所有离子进行高速的碎裂、扫描和检测,理论上可获取所有离子的碎片信息。DIA蛋白质组学就是利用基于DIA采集模式的质谱技术对蛋白质组学进行研究,SWATH是zuì常见的一种DIA蛋白质组学技术, SWATH技
DIA蛋白质组学分析步骤
DIA蛋白质组学分析步骤-详情DIA蛋白质组学利用基于数据非依赖采集模式的质谱技术进行蛋白质组学研究,可对复杂的、大规模的蛋白样本进行高分辨率和高灵敏度的精确定量鉴定。DIA蛋白质组学分析步骤:(1)将分离纯化后的蛋白提取物通过多重酶切反应酶切消化成小分子肽段,(2)然后利用高效液相色谱对肽段进行分离,(3)对分离后的肽段在SWATH模式下进行质谱检测,(4)zuì后结合相关软件和生物信息学分析手段对质谱数据进行深度
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