IP胶条测序
IP胶条测序-详情蛋白混合物进行免疫沉淀反应(IP)后,可以得到与目标蛋白相互作用的靶蛋白,此时一般需要对靶蛋白进行进一步的鉴定,如分子量、含量、翻译后修饰以及一级结构表征等,以全面了解靶蛋白的相关信息。凝胶电泳是检测分子量zuì简单的方法,将IP免疫沉淀获得的靶蛋白进行凝胶电泳,电泳结束后蛋白胶条所处的位置对应的Maker的大小就是该靶蛋白的分子质量,此时如还要进行靶蛋白一级结构分析,可以将该蛋白胶条进行回收
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2023-09-11 09:30
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HPLC多肽分子量测定
HPLC多肽分子量测定-详情分子量是化合物的基本理化参数,指组成化合物的各原子的相对原子质量之和,也是蛋白质/多肽的重要特征参数之一,在蛋白质/多肽的鉴定中扮演着十分重要的角色,分子质量的正确与否也是判断其结构正确与否的一个重要指标。常用的蛋白质/多肽的分子量鉴定方法包括SDS-凝胶电法、粘度法、凝胶渗透色谱法、凝胶过滤层析法以及质谱法等。凝胶渗透色谱法(Gel Permeation Chromatography,GPC)和凝胶过滤层析法(
HPLC蛋白纯度
HPLC蛋白纯度-详情HPLC(High Performance Liquid Chromatography)高效液相色谱法,也称为高压液相色谱,是一种用于分离、鉴定和量化混合物中的每种成分的分析化学技术。它依靠高压泵将含有样品混合物的液体通过充满固体吸附材料的色谱柱,样品中的每种成分与吸附材料的相互作用略有不同,导致不同成分的流速不同,并导致成分在流出色谱柱时发生分离。蛋白质纯度是蛋白质分析研究中一个重要的理化参数,不纯的蛋白质样本可能会导
免疫共沉淀结合蛋白质质谱
免疫共沉淀结合蛋白质质谱-详情免疫共沉淀技术(Co-Immunoprecipitation,Co-IP)是利用抗体与抗原特异结合的原理研究体内蛋白质相互作用的经典方法。该技术使用非变性剂裂解细胞,保留细胞中蛋白质A-蛋白质B间的相互作用,再将其与蛋白A的专一性抗体混合,此时抗体会与蛋白A结合使其沉淀,同时蛋白B也被共沉淀下来。免疫共沉淀结合蛋白质质谱就是将Co-IP得到的两种蛋白质利用质谱技术进行后续定性和定量分析。Co-IP质谱分析可以用
非标记定量蛋白质组
非标记定量蛋白质组-详情当前用于蛋白定量的方法可分为标记策略和非标记策略,标记策略是利用同位素标签进行体外或体内标记蛋白,再将标记蛋白进行量化检测。非标记策略不使用同位素标签,直接对蛋白样本进行分析。常用的非标记定量蛋白质策略主要包括荧光染料法、基于质谱的Label Free技术等。荧光染料法利用荧光染料对电泳分离的蛋白进行染色,通过荧光成像仪成像,以数字化形式采集和保存相关信息,依靠软件分析进行图谱的点检
De novo测序
De novo测序-详情De novo测序,又称从头测序,是一项不依赖于任何已知或参考序列的测序技术,它利用生物信息学分析技术将序列片段进行拼接、组装以实现整个序列的鉴定,可用于未知基因组、转录组和蛋白质的全序列分析。从头测序zuì重要、zuì关键的就是对已测得的小片段进行拼接、组装,如果在这个过程中发生拼接错误,那么将会导致整个测序结果不准确。因此,在测序前将待测样品进行多重酶切以及对序列进行反向验证是保证片段全
蛋白组学种类
蛋白组学种类-详情蛋白质组学就是研究某个机体表达的全套蛋白质或一个体系内所有蛋白质的科学,旨在对蛋白质进行全面综合分析以揭示生命活动的规律和分子机制。根据不同的研究目的,可以将蛋白组学分为表达蛋白质组学、功能蛋白质组学和结构蛋白质组学三大分支。表达蛋白质组学是观察某种细胞或组织中蛋白质的整体表达,分析不同状态条件下蛋白质表达量变化的科学。表达蛋白质组学侧重于用图谱的方式显示、衡量和分析蛋白质表达的
蛋白组学iTRAQ是绝对定量还是相对定量
蛋白组学iTRAQ是绝对定量还是相对定量-详情iTRAQ即同位素标记相对定量和jué对定量等压标签,是美国AB SCIEX公司开发的一种体外肽标记定量蛋白质组学研究技术。其基于4种或8种同位素标签实现氨基酸基团的特异性标记,将标记的样品通过色谱分离并进行串联质谱分析,根据报告基团的质谱峰强度或峰面积可以对每一个肽段进行相对定量;如果合成一个内标肽,同时用iTRAQ试剂标记,就可以通过加入的内标肽和待测肽段报告基团的峰强度或峰
蛋白组差异分析
蛋白组差异分析-详情蛋白质是细胞功能的直接执行者,由于细胞或组织中蛋白质种类和含量有所差异,因此它们行使不同的生物学功能,扮演不同的角色。蛋白组差异分析就是分析不同样本如正常与病理状态样本、未处理与特殊处理条件下样本之间蛋白种类和含量的差异,通过寻找有意义的差异蛋白来揭示样本的生理或病理变化的分子机制。差异蛋白组学在揭示生命活动的本质方面扮演着重要的角色,广泛应用于各类疾病的发生研究、临床诊断以及
蛋白质组学检测采样
蛋白质组学检测采样-详情蛋白质组学分析需要有合乎检测标准的蛋白样本,准备好的样本就是实验取得成功的前提条件,不同类型蛋白样品的收集与预处理有不同的要求。动植物常规器官组织样本如根、茎、叶、花、心、肝、脾、脑等通常需要使用PBS将表面的污渍清洗干净,并去除无关干扰组织,再切成大小适宜的小块,zuì后用液氮速冻,于-80℃保存。细胞类样本如细菌、培养细胞等需先离心收集细胞沉淀,再用预冷的PBS进行重悬清洗,再离心
泛素蛋白组学
泛素蛋白组学-详情泛素(Ubiquitin,Ub)本身是一种小分子多肽,在相关酶的作用下,Ub通过共价键连接在底物蛋白或目标蛋白上,这一过程就称为泛素化修饰。泛素化修饰(Ubiquitylation)是一种广泛存在于真核生物中的蛋白翻译后修饰。泛素蛋白组学就是以泛素化蛋白质为研究对象,探究其随各种生命进程的变化规律的科学。泛素化修饰主要介导蛋白质发生降解,但随着蛋白泛素化修饰的深入研究,人们发现泛素化修饰还可以参与调节其他的
多组学
多组学-详情随着高通量测序技术的发展,基因组、蛋白质组、转录组、代谢组、微生物组和脂质组等的数据被大量挖掘并应用于各类研究。为进行更深入的生命科学研究,满足系统学研究的需要,多组学应运而生。多组学将不同的组学数据进行整合分析,挖掘单一组学研究不能获取的数据,全面系统的分析各类物质的相互作用网络,促进我们更深刻的理解生理过程和分子机制,为网络生物学、系统生物学的研究提供了重要的技术手段。百泰派克生物
免疫共沉淀
免疫共沉淀-详情免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation, Co-IP)是在免疫沉淀的基础上发展起来的研究蛋白质相互作用的分析技术,是免疫沉淀技术的补充和延伸。很多刚入门的小白可能对免疫共沉淀Co-IP还不是很了解,所以今天小编带大家一起来了解免疫共沉淀的技术原理。免疫共沉淀基于抗体与抗原特异结合的原理,利用专一性抗体特异性识别混合体系中两个相互作用的蛋白质中的其中一个,然后将两者一起沉淀出来,用来鉴定两种已知蛋白
蛋白质组学的研究内容
蛋白质组学的研究内容-详情根据研究内容的不同,蛋白组学可以分为表达蛋白质组学、功能蛋白质组学和结构蛋白质组学三个分支。表达蛋白质组学是研究生物体在不同发育时期、不同环境、疾病或药物处理下细胞或组织中蛋白质表达情况的科学,其主要研究技术包括蛋白分离技术、质谱分析技术、基因表达系列分析技术和微测序技术等。功能蛋白质组学是通过分析蛋白间的相互作用、蛋白质的三维结构、蛋白质细胞定位以及翻译后修饰来明确蛋白
蛋白质组学PRM
蛋白质组学PRM-详情平行反应监测PRM(Parallel Reaction Monitoring)是一种基于多反应检测技术(MRM)发展起来的研究靶向蛋白质的数据采集技术,其通过高分辨、高精度质谱仪(一般为Q-Orbitrap)对目标蛋白质或修饰肽段进行选择性的检测,以实现对目标蛋白质或肽段的相对/jué对定量,是蛋白质靶向定量研究的有力工具。PRM具有比MRM更高的质量精度,可以有效地消除背景干扰和假阳性,检测限度和灵敏度得到大幅度提高;此外,PRM可
蛋白质组定量
蛋白质组定量-详情蛋白质是生命物质的承担者,生物体的组织或细胞内的蛋白质种类和含量的变化与其生命机能有着密切的联系。定量蛋白质组学是把一个细胞、组织或生命体中所有的蛋白质或一个混合体系中(通常为体外)所有的蛋白质作为研究对象,对其进行精确的鉴定和定量,用于揭示生物体生命活动过程中蛋白质的变化。目前,定量蛋白质组学技术主要包括Label Free、SILAC、iTRAQ、TMT、2D-DIGE荧光定量、DIA定量、SWATH定量等。其中L
蛋白质组测序技术
蛋白质组测序技术-详情“蛋白质组”(Proteome)是指“一个基因组表达的全套蛋白质或一个混合体系内的所有蛋白质”。蛋白质组学技术以蛋白质组为研究对象,从整体水平上分析细胞、器官、组织和有机体的蛋白质组成、结构功能以及相互作用网络,旨在从分子层面揭示生命活动和各种疾病发生的机理。进行蛋白质组学研究,shǒu先要解决蛋白质鉴别的问题,蛋白质组学测序技术就得以产生和发展。目前常用的蛋白质组学测序技术主要包括质谱
蛋白质组学
蛋白质组学-详情“蛋白质组”(Proteome)一词源于蛋白质“PROTEin”与基因组“genOME”两个词的杂合,意指“一个基因组表达的全套蛋白质”。“蛋白质组学”(Proteomics)是以蛋白质组为研究对象,从整体水平上分析一个有机体、细胞或组织的蛋白质组成及其活动规律的科学。蛋白质组学是在20世纪基因组学研究取得巨大成就的基础上发展起来的。基因组学研究促进了蛋白质组学研究的发展,蛋白质组学的研究又延伸了基因组学研究的深度
蛋白质质谱测序
蛋白质质谱测序-详情目前,蛋白质序列的分析方法主要包括质谱法和非质谱法,而质谱法凭借其高分辨率、高灵敏度和准确度的优点已成为zuì广泛使用的蛋白序列分析法。蛋白质质谱测序主要是基于质谱仪分析,可以实现蛋白全序列测定、蛋白末端(C/N端)测序以及从头测序。进行蛋白质质谱测序需要将待测的、纯的蛋白样品进行酶解,然后对肽段碎片进行串联质谱分析,根据质谱数据(如肽段母离子的质荷比,强度等)结合相应数据库推算出肽
蛋白质直接测序法
蛋白质直接测序法-详情蛋白质直接测序是相对间接测序的一种方法,蛋白间接测序就是根据该蛋白的基因序列对蛋白的氨基酸序列进行推导,得到的是理论的蛋白序列,往往不能准确反应该蛋白的真实氨基酸序列,因此,蛋白直接测序法就得以产生和发展。蛋白直接测序shǒu先需要将蛋白质的多肽链进行拆分,对多肽链的数目进行鉴定;然后再断裂肽链中的二硫键,并测定肽链的氨基酸组成以及氨基酸成分的分子比值;接下来对肽链的C端和N端序列
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