TMT质谱
TMT质谱-详情之前的文章已经对TMT技术的定义和原理等进行了简单的介绍,这篇文章我们来聊一聊TMT质谱。那什么是TMT质谱呢?TMT质谱就是将TMT技术与HPLC-MS(高效液相色谱串联质谱)技术结合起来进行蛋白质定量分析的技术手段。TMT质谱分析蛋白质的大致流程如下:将待分析的不同的蛋白质样品酶解消化成肽段;然后利用TMT试剂标签进行标记,并混合为一个样品;再通过液相色谱将混合样品进行分离,并将馏分串联为12个样品;zuì后通过
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2023-09-11 09:28
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TMT标记
TMT标记-详情串联质量标签TMT(Tandem Mass Tag)是美国Thermo Fisher公司研发的一种体外标记蛋白定量技术。其基本原理是将水解后得到蛋白质多肽氨基酸N端和赖氨酸残基利用TMT试剂标签进行标记,然后进行质谱分析,通过串联质谱获得的离子峰强度和离子峰质荷比进行蛋白质的定性和定量分析。TMT实验单次zuì高可同时对16种不同的生物样品进行检测,通量相比其他体外标记技术有很大的提高;此外,TMT报告基团间zuì小分子质量差达6/1
TMT、iTRAQ
TMT、iTRAQ-详情研究蛋白质含量的技术目前主要分为标记(Label)和非标记(Label Free)两种策略,标记策略又分为体外标记和体内标记,TMT和iTRAQ是两种不同的体外标记蛋白定量技术。很多人可能以为二者是不同的技术,其实它们只是由不同公司开发的标记标签,有各自的优缺点,基本原理相似,都用于蛋白体外标记定量研究。iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)即同位素标记相对和绝对定量技术,是美国AB
SWATH
SWATH-详情SWATH(Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragment ions)是ETH Zürich的Dr. Ruedi Aebersold团队与美国AB-SCIEX公司联合开发的一项全新的基于质谱的数据采集模式技术。SWATH作为一种DIA(数据非依赖采集模式)技术,将扫描范围划分为以25 Dalton 为间隔区间,对样本的所有离子信息进行超高速的循环检测,缺失值更少,检测更全面,是一种真正全景式的、高通量的质谱检测手段MS/M
SUMO化蛋白质组学
SUMO化蛋白质组学-详情类泛素蛋白修饰分子是一类小分子蛋白,该小分子蛋白可以在酶的作用下通过级联反应共价结合到其他蛋白质上,即发生类泛素化修饰(Small ubiquitin-like modifier,SUMO)。类泛素化修饰是一种常见的蛋白翻译后修饰,在许多真核生物的细胞质和细胞核中常有发生。与泛素化修饰相比,SUMO化修饰不会介导靶向蛋白质进行蛋白水解,而是参与其他调节其他生物学过程,如蛋白稳定性、核-胞浆转运、亚细胞定位、转录调
GPC测血浆蛋白
GPC测血浆蛋白-详情GPC(Gel permeation chromatography)即凝胶渗透色谱,又称尺寸排阻色谱(size exclusion chromatography,SEC),是一种液相色谱。GPC 基于分子大小而不是化学特性进行分离,采用尺寸排阻色谱原理根据溶解的样品从填充有多孔凝胶的色谱柱中的洗脱情况,按大小分离他们,是测定聚合物分子量的常用方法,并且能够提供有关聚合物分子量分布的准确、可靠的信息,常用于高分子生物材料的表征。凝胶渗透色谱可以对血
GC色谱分析
GC色谱分析-详情色谱法(Chromatography)是上世纪五十年代出现的一种化合物分离、分析技术,在化学、生物医学、药学以及食品领域的分离和分析中广泛应用。色谱法的分离以化合物在流动相与固定相之间的相互作用为基础,当溶于流动相中的化合物经过固定相时,由于与固定相发生作用的大小以及强弱不同,导致化合物在固定相中滞留的时间不同而先后从固定相中流出,从而实现各化合物组分的分离。根据流动相的物理状态,可以将色谱法分
GCMS代谢组学
GCMS代谢组学-详情代谢组学(Metabolomics)是研究细胞、组织、器官或生物体内所有内源性小分子代谢物的科学,如氨基酸、糖类、脂肪酸、甾醇、儿茶酚胺和生物胺等,通过对其种类、含量以及变化规律的研究,旨在表征和定量生物系统中的代谢组,揭示机体在不同状态下的代谢通路。作为基因组、转录组以及蛋白质组的“终端”产物,代谢组可以更直接的反映生物体的生理和病理状态,为临床诊断、疾病治疗以及寻找生物标志物提供了新的方
GC-MS非靶标代谢组分析
GC-MS非靶标代谢组分析-详情代谢组学是一种全面的代谢分析方法,能以无偏见的方式同时分析广泛的代谢物类别。代谢组学方法可分为靶向和非靶向两种。靶向代谢组学是指对一组选定的代谢物(例如氨基酸、脂质、糖和/或脂肪酸)进行定量测量,以研究特定的代谢途径或验证使用非靶向代谢分析确定的生物标志物。相比之下,非靶向代谢组学方法涉及代谢组的全局分析,旨在快速可靠地识别特定生理状态的小分子生物标志物,与靶向代谢组学相
FFPE定量蛋白质组学
FFPE定量蛋白质组学-详情FFPE(formalin fixation and paraffin embedding)即福尔马林固定的石蜡包埋样本,能在室温下zuì大限度的封存某一状态下的样本,广泛应用于组织学和形态学结构的保存。一些临床上的石蜡包埋样本对疾病组织病理学诊断具有jí高应用价值,是研究癌症等重大疾病的宝贵资源。FFPE定量蛋白质组学通过质谱技术对FFPE 组织蛋白提取液中的蛋白组分进行精确定量分析,对比正常与病理状态下蛋白质的表达情况,发现
CD24糖基化位点
CD24糖基化位点-详情糖基化是真核生物中常见的较复杂的蛋白翻译后修饰方式,在维持和调控机体各项生命活动中扮演着重要角色,一些异常的蛋白糖基化可能还与疾病的发生有密切关系。CD24是一种由31个氨基酸组成的小分子短肽,又称为热稳定抗原或小细胞肺癌簇4抗原,与鼠热稳定抗原高度同源。CD24是一种高度糖基化的细胞粘附分子,通过磷脂酰肌醇锚定在细胞膜内的脂质筏上,介导细胞与细胞和基质间的黏附,在细胞识别、信号转导、增值
Bottom-up测序
Bottom-up测序-详情通过质谱进行蛋白质组学分析主要有“自上而下”(Top-down)和“自下而上”(Bottom-up)两种策略。“自上而下”策略对完整的蛋白质或多肽进行全局分析,“自下而上”策略通过对蛋白质或多肽水解后的小分子肽段进行分析从而实现完整蛋白或多肽的鉴定分析等。Bottom-up测序基于自下而上的策略对蛋白质进行序列分析,是一种较为传统的蛋白质测序手段。与基因测序的原理相似,通过拼接多种蛋白酶切割蛋白质产生的肽
ADC药物蛋白质组学
ADC药物蛋白质组学-详情药物蛋白质组学就是将蛋白质组学理论研究技术与药物研究领域相结合的新兴科学。其研究的基本内容为通过对比正常和病理状态下的细胞或组织的蛋白质表达情况,对药物作用机制和药物不良反应等进行分析,旨在寻找新的药物靶点、构建分子药理筛选模型等。ADC(抗体偶联药物)是一类结合免疫疗法和化学疗法的新型生物药物,其开发涉及单克隆抗体及抗体靶点的选择、连接物和化学物的选择。ADC药物蛋白质组学研究可
ADCs药物的DAR
ADCs药物的DAR-详情抗体偶联药物(Antibody-Drug Conjugates,ADCs)是将具有高度靶向性的单克隆抗体与具有强效杀伤力的细胞毒素通过特定的偶联剂连接在一起的新型药物,对靶标细胞同时具有高度选择性和杀伤力,在癌症以及肿瘤等疾病的治疗中具有重要作用。抗体偶联药物的制备一般是先将重组抗体与特殊的连接子结合形成抗体-偶联剂复合物,再将其与化学药物——细胞毒素相连。然而在这个过程中可能会由于连接不成功产生未偶联的裸
ADCs
ADCs-详情ADCs(Antibody-Drug Conjugates)即抗体偶联药物,是一类由重组抗体和细胞毒素通过偶联剂连接在一起形成的新型生物药物,在肿瘤和癌症的治疗中具有很重要的应用价值。ADCs由三部分组成:重组的单克隆抗体、具有药效的细胞毒素以及特殊的连接物。重组的单克隆抗体具有很强的靶向性,能特异性的识别肿瘤细胞,但是其对靶标肿瘤细胞的伤害度不高;细胞毒素对肿瘤细胞具有很强的杀伤力,但是其特异性较差,会同时伤害到机体
Edman降解法相对于质谱法有何优势
Edman降解法相对于质谱法有何优势-详情Edman降解法和基于质谱的方法是目前zuì常用的蛋白质序列分析方法,Edman降解法主要用于蛋白质N末端序列的测定,质谱法可对蛋白质全长序列进行分析,也可用于N/C端序列分析,这两种方法都有各自的优点和局限,Edman降解法相较于质谱测序法具有以下几点优势:(1)Edman测序法每次对一个被降解下来的氨基酸进行鉴定,鉴定结果准确度高;(2)Edman降解法不依赖任何蛋白质序列数据库,可对数据
SDS-PAGE蛋白纯度鉴定
SDS-PAGE蛋白纯度鉴定-详情一般实验分离的蛋白质常常会含有一些杂质蛋白或提取步骤中使用的试剂等,影响后续实验的顺利进行,因此有必要对其进行纯化,并对纯化结果进行检测,即蛋白质纯度测定。蛋白质纯度测定可以评价蛋白质是否含有杂质以及杂质的含量,是进一步研究蛋白质至关重要的环节。一些蛋白产品尤其要进行纯度检测,以确保产品的质量和安全性。随着生命科学研究的发展进步,蛋白纯度鉴定的方法也越来越多样化,包括电泳
Edman法一次可以测出多少序列
Edman法一次可以测出多少序列-详情Edman降解法是针对蛋白质N末端氨基酸序列分析的方法,用于测定蛋白质N末端的氨基酸序列。基于Edman降解法的测序仪一般只能连续降解并测定几十个(60~70)N末端氨基酸,zuì多不会超过一百个。对于更长的N末端序列或者蛋白质的全长序列,可以利用蛋白酶将其水解为多个小片段的短肽,然后利用Edman降解法进行分析,通过序列拼接实现更长序列的N末端序列分析甚至蛋白质全长序列鉴定。百泰派克公司采
Edman降解测序的试剂及其基本原理是什么
Edman降解测序的试剂及其基本原理是什么-详情Edman降解法是蛋白质N末端序列分析的经典方法,其利用一系列化学反应每次从肽链上切下一个氨基酸并进行鉴定,如此循环以完成N末端氨基酸的序列测定。Edman降解法主要用到的试剂为异硫氰酸苯酯(PITC),PITC能与蛋白质多肽的N末端氨基酸残基发生偶联反应生成苯氨基硫甲酰衍生物(PTC-肽),在三氟乙酸处理下,N末端氨基酸的肽键被选择性的切断,释放出含有该末端氨基酸的噻唑啉酮苯胺(
DNFB和Edman原理相同吗
DNFB和Edman原理相同吗-详情DNFB和Edman是两种不同的蛋白质N末端序列分析方法,其原理不相同但是非常类似,都是利用化合物与蛋白质的末端氨基酸进行反应生成氨基酸-化合物复合体,再对该产物进行鉴定从而实现N末端氨基酸序列的分析,只是两者利用的化合物以及反应的原理不同。下面对两种方法的原理进行简单介绍。DNFB即2, 4-二硝基氟苯,在弱碱性环境(pH=8.0~9.0)下可以与蛋白质N末端的α氨基酸结合生成稳定的2, 4-二硝基苯氨基
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