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  • DIA定量蛋白质组实验步骤

    DIA定量蛋白质组实验步骤

    DIA定量蛋白质组实验步骤-详情DIA(Data independent acquisition)是基于静电场轨道阱Orbitrap质谱的一项全新的、全息式数据非依赖性采集定量技术。DIA定量蛋白质组学分析即采用DIA数据采集模式对特定质量区间内的所有肽段母离子进行二级质谱检测,并结合高质量肽谱图库对扫描的所有母离子的碎片信息进行蛋白质组学分析。采用DIA进行蛋白质分析无需指定目标肽段,且其扫描点数均匀,利用谱图库即可实现定性确证和定量离子筛选,并

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  • 蛋白质组学中DDA

    蛋白质组学中DDA

    蛋白质组学中DDA-详情根据采集方式的不同,高分辨率质谱仪的原始数据可以分成DDA和DIA两种,DDA(Data-Dependent Acquisition)即数据依赖采集模式,在DDA模式的采集方式中质谱仪先采集一次一级质谱数据,再选择离子强度较强的肽段母离子进入二级质谱继续进行碎裂得到二级质谱图。DIA(Data-Independent Acquisition)数据非依赖采集模式,即质谱分析中一级质谱数据采集之后,无区别的将肽段母离子进行二级质谱碎裂得到质谱数据,

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  • iTRAQ定量蛋白质组学分析

    iTRAQ定量蛋白质组学分析

    iTRAQ定量蛋白质组学分析-详情iTRAQ定量蛋白质组学是一种基于体外等质量同位素标签研究蛋白质组相对和jué对定量的技术,可分析不同样本中的蛋白质组成差异。iTRAQ技术利用4-8种不同的同位素试剂标记酶解后的肽段氨基(即氨基酸N-末端和赖氨酸侧链基团),经过液相色谱串联质谱技术检测得到一级质谱图和二级质谱图,解析质谱数据可实现4-8种不同样品间蛋白质的定量检测,是蛋白质组学常用的高通量定量技术。百泰派克生物科技采用Th

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  • itraq技术

    itraq技术

    itraq技术-详情蛋白质组学即对一种细胞甚至一种生物所表达的所有蛋白质进行研究的科学,通过质谱平台对蛋白质进行全面研究以实现对生物体生理活动的整体认识。随着蛋白组学的快速发展,研究蛋白质组学的技术也在不断开发并推动着蛋白组学的发展,相对和jué对定量同位素标记技术(iTRAQ)与串联质谱、多维液相色谱技术联用已成为蛋白质定性和定量研究的主流技术之一。iTRAQ技术操作流程:shǒu先,不同蛋白质样品分别用胰蛋白酶裂

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  • N-糖基化类型

    N-糖基化类型

    N-糖基化类型-详情蛋白质糖基化是蛋白质翻译后修饰(PTM)中zuì为丰富和多样化的一种修饰类型,根据连接氨基酸残基不同,糖基化主要分为 N-糖基化、O-糖基化、C-连接糖基化、糖基磷脂酰肌醇(GPI)锚四大类型。不同的修饰类型功能有所不同,其中研究zuì多的是 N-糖基化,占PTM的50%。N-糖基化会影响糖蛋白的很多特性,包括构象、溶解性、免疫原性以及糖基化蛋白的识别等。N-糖基化(N-linked glycosylation)是一种新生肽链的共

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  • TMT和iTRAQ技术原理

    TMT和iTRAQ技术原理

    TMT和iTRAQ技术原理-详情iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技术是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术,是基于体外等质量同位素标记的相对或jué对定量技术。其使用多种不同的等质量同位素试剂作为标签,同时标记多种不同蛋白质样品并将其混合为一体进行检测。这些等质量同位素标签试剂由3个不同的化学标签组成:报告部分、肽反应部分和平衡部分。报

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  • 糖基化修饰蛋白

    糖基化修饰蛋白

    糖基化修饰蛋白-详情糖基化是一种结构多样和复杂的蛋白质翻译后修饰(PTM),其通常发生于细胞中50%-70%的蛋白质上。糖基化可影响蛋白质的三维空间结构或决定蛋白质在细胞内的传送方向等,被糖基化修饰的蛋白质称为糖蛋白,糖基化修饰蛋白作为zuì为常见和复杂的蛋白质修饰方式,其具有重要的生物学意义。蛋白质糖基化(glycosylation)是蛋白质上的某些氨基酸残基在糖基转移酶的催化下形成糖苷键的过程,是一种很重要的蛋白质翻译

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  • itraq定量蛋白组学和tmt蛋白组学

    itraq定量蛋白组学和tmt蛋白组学

    itraq定量蛋白组学和tmt蛋白组学-详情标记定量蛋白质组学即针对多组不同样品间的全部蛋白质进行标记定量研究。iTRAQ定量蛋白质组学和TMT蛋白质组学采用多种同位素标记,实现多个样本蛋白组的定性与定量。iTRAQ和TMT分别是由Thermo 公司和 AB SCIEX公司研发的多肽体外标记定量技术,是目前运用zuì广泛的两种标记定量蛋白质组技术。iTRAQ技术(同位素标记相对和jué对定量技术)是一种基于体外同位素标记的蛋白质组学定量研究技术,

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  • 糖基化类型

    糖基化类型

    糖基化类型-详情糖基化是聚糖在糖基转移酶的作用下转移至蛋白质或脂质上的过程,通常发生于细胞液内质网中。蛋白质糖基化是聚糖在糖基转移酶的作用下转移到蛋白质上特殊氨基酸残基上形成糖苷键的过程,糖蛋白即经过糖基化修饰的蛋白质。糖基化是对蛋白的重要的修饰作用,有调节蛋白质功能作用。研究表明,人体中约70%的蛋白质上包含一条或多条糖链,人体中约1%的基因组参与了糖链的合成与修饰。蛋白质糖基化类型通常可根据糖苷链的

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  • LFQ定量蛋白组学

    LFQ定量蛋白组学

    LFQ定量蛋白组学-详情LFQ定量蛋白质组学即无标记定量(Label Free Quantitation,LFQ)蛋白质组学,是基于质谱检测的无标记定量技术对样品中蛋白质进行相对定量检测分析的技术。无标记定量蛋白质组学是一种无须依赖同位素标记的蛋白质相对定量分析技术,其通过液质联用对蛋白酶肽段进行检测,分析大规模蛋白质鉴定时所产生的的质谱数据,根据质谱所检测到的离子峰强度积分面积对蛋白质进行相对定量分析。通常,可直接通过质谱信号

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  • 糖基化结构

    糖基化结构

    糖基化结构-详情"糖基化修饰(Glycosylation)是糖链在糖基转移酶催化作用下,共价连接到蛋白质侧链特殊氨基酸上的过程,经过糖基化修饰的蛋白称为糖蛋白。糖基化结构是由糖链结构及其与氨基酸的连接方式共同决定,糖链的多样性及其与不同氨基酸的连接方式不同,均可构成不同的糖基化结构。糖链结构组成比较复杂,其主要由葡萄糖(Glucose,Glc)、半乳糖(Galactose,Gal)、甘露糖(Mannose,Man)等单糖组合而成。糖链的长度、

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  • 糖基化位点差异分析

    糖基化位点差异分析

    糖基化位点差异分析-详情"糖基化修饰是指肽链生物合成的同时或合成后,糖链在糖基转移酶的催化下连接到肽链上的特定糖基化位点的过程。被糖基化修饰的蛋白质称为糖蛋白,糖蛋白上氨基酸残基与糖链相结合的位点为糖基化位点。通过准确的捕获和分析糖基化位点差异,可分析糖链和糖蛋白作用及其生物学功能。糖基化位点差异分析主要通过质谱技术对糖链和糖肽进行鉴定,之后结合糖链结构和糖肽序列进行生物信息学分析,从而得到糖基化位

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  • 糖基化位点预测有什么用

    糖基化位点预测有什么用

    糖基化位点预测有什么用-详情"蛋白质糖基化修饰(Protein glycosylation)是糖链在糖基转移酶的作用下转移至蛋白质侧链功能基团或氨基酸残基上的过程,其本质是聚糖(Glycan)在糖基转移酶的作用下与蛋白质通过共价键结合生成糖苷键的酶促反应。经过糖基化修饰的蛋白称为糖蛋白,糖蛋白的基本结构是蛋白肽链与糖链通过共价键相连,蛋白链上连接糖链的位点称为糖基化位点。由于糖链的生物合成没有模板可以遵循,因此在同一个糖基化

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  • 糖基化位点怎么分析

    糖基化位点怎么分析

    糖基化位点怎么分析-详情"糖基化位点是糖基化修饰过程中蛋白质肽链上共价连接糖链的氨基酸位点,可通过准确的捕获和分析糖基化位点来研究糖链、糖肽及其完整糖蛋白的功能。为了获得带有糖基化修饰的蛋白质并鉴定出糖基化修饰位点,通常需要结合酶解法处理、质谱法检测以及生物信息学分析才能实现。在进行糖基化位点分析之前,shǒu先需要对糖基化修饰蛋白及糖肽进行富集,富集得到的糖蛋白使用酶解法(如糖苷酶)或化学法切除连接

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  • itraq labeling和label free

    itraq labeling和label free

    itraq labeling和label free-详情"目前,除了标准的基于质谱(MS)的蛋白质定性鉴定外,通过MS对蛋白质进行定量在蛋白质组学研究中也迅速获得认可。iTRAQ Labeling和Label Free是广泛应用于蛋白质组学定量的两种常用的方法,即iTRAQ标记(iTRAQ labeling)和非标记(label free)定量技术。无论iTRAQ标记定量还是非标记定量,两者都可对蛋白质组学进行非靶向的、定性定量的分析。非标记定量是不使用任何同位素标记,直接对蛋白质肽

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  • 无标定量蛋白组学

    无标定量蛋白组学

    无标定量蛋白组学-详情"蛋白质组(proteome)指一个细胞或一个组织基因组(特定时间、空间)所表达的全部蛋白质。而蛋白质组学(proteomics)则是以蛋白质组为研究对象,对蛋白质组的表达水平、细胞内定位、蛋白间交互作用、翻译后修饰以及在不同细胞时间上功能表达的异质性进行分析的科学。定量蛋白质组学是利用质谱平台检测样品中蛋白相对含量的分析化学技术,无标(Label free)定量蛋白质组学指不依赖于同位素标记的蛋白质定量

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  • label-free定量蛋白组学结果分析

    label-free定量蛋白组学结果分析

    label-free定量蛋白组学结果分析-详情"无标签(label-free)定量蛋白组学中,蛋白质样品经过液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术检测分析以后得到的数据,需要通过一系列后处理才能获得其肽段氨基酸序列组成。处理方法可以分为3类:数据库搜索法、从头测序法和肽序列标签法。数据库搜索法:肽段的MS/MS谱图与理论谱图比对,从已有的蛋白质谱库中搜索,比对成功即可鉴定。目前使用较多、应用zuì广泛的搜库软件是Mascot,其检索方式包

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  • 蛋白糖基化组

    蛋白糖基化组

    蛋白糖基化组-详情"蛋白质糖基化(Glycosylation)是一种较为常见且复杂的翻译后修饰(PTM),蛋白质糖基化修饰即聚糖在糖基转移酶的催化作用下转移至蛋白质侧链氨基酸残基上的过程。经过糖基化修饰的蛋白质称之为糖蛋白,糖蛋白对细胞运输和定位、免疫识别、信号传递等生物过程具有重要作用。糖基化组是指一个生物体、组织或细胞所表达的所有糖基化蛋白。糖基化组研究是对经过糖基化修饰后的蛋白进行鉴定,即对糖蛋白的全面分析与

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  • 蛋白质结合质谱

    蛋白质结合质谱

    蛋白质结合质谱-详情"质谱技术已成为研究生物大分子特别是蛋白质的主要支撑技术之一,蛋白质结合质谱分析具有高灵敏度和准确性、易操作性、快速性及很好的普适性。质谱分析能为亚微克级试样提供信息、有效地与色谱联用并用于复杂体系中痕量物质的鉴定或结构测定。质谱分析方法与蛋白质分析的联系密切,蛋白质是一条或多条肽链以特殊方式组合的生物大分子,其复杂结构主要包括一级、二级、三级或四级结构。目前蛋白质结合质谱分析测

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  • 蛋白糖型

    蛋白糖型

    蛋白糖型-详情"蛋白质糖基化修饰是糖链在糖基转移酶的作用下与肽链氨特殊氨基酸残基以糖苷键的方式共价结合,zuì终形成糖蛋白的过程。蛋白质糖基化修饰是一种重要的翻译后修饰,蛋白糖型是指经过糖基化修饰形成的糖蛋白上所结合糖链的种类和结构。据统计,生物体中的蛋白质糖基化修饰对应的糖链结构和种类远超过蛋白质种类。通常生物体中糖蛋白中的糖链均可由10种单糖组合而成,即葡萄糖(Glc)、半乳糖(Gal)、甘露糖(Man)、

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